Salut,
Oui, ce sont deux choses différentes, éventuellement complémentaires.
Pour l'auto-apprentissage, les règles s'établissent toutes seules et s'affinent en permanence. Une fois mis en place, il n'y a plus rien à faire, sauf éventuellement mettre dans le répertoire junkmail ceux qu'on veut voir pris en compte comme spam.
Pour local.cf, on peut définir soi-même ses propres règles, qui sont immédiatement prises en compte. Dans la mesure où il y a des mails qu'on sait pertinemment être du spam (ceux qui proposent du viagra par exemple), c'est mieux de mettre une règle fixe : ça évite que des ressources soient utilisées pour un long apprentissage
A noter que j'élimine certains mails par ce moyen, alors qu'il y aurait avantage à les éliminer beaucoup plus tôt... Voir les explications super intéressantes de ccnet.